Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB1P05556 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB1P05556 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB1P05556 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms