Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFAP2AP05549 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFAP2AP05549 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms