Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCCBP05166 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCCBP05166 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCCBP05166 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCCBP05166 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCCBP05166 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCCBP05166 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCCBP05166 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCCBP05166 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCCBP05166 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCCBP05166 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCCBP05166 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCCBP05166 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCCBP05166 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCCBP05166 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCCBP05166 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCBP05166 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCBP05166 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCBP05166 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCBP05166 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCCBP05166 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCBP05166 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCBP05166 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCBP05166 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCBP05166 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCBP05166 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCBP05166 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCBP05166 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCBP05166 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCCBP05166 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCBP05166 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCBP05166 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCCBP05166 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCCBP05166 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCBP05166 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCBP05166 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCBP05166 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCCBP05166 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCBP05166 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCCBP05166 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCCBP05166 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCCBP05166 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCCBP05166 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCCBP05166 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCCBP05166 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCCBP05166 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCCBP05166 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCCBP05166 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCCBP05166 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCCBP05166 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCCBP05166 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCCBP05166 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCCBP05166 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCCBP05166 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCCBP05166 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCCBP05166 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCCBP05166 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCCBP05166 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCCBP05166 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCCBP05166 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCCBP05166 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCCBP05166 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCCBP05166 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCCBP05166 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCCBP05166 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCCBP05166 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCCBP05166 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCCBP05166 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCCBP05166 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCCBP05166 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCCBP05166 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCCBP05166 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCCBP05166 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCCBP05166 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCCBP05166 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCCBP05166 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCCBP05166 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCCBP05166 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCCBP05166 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCCBP05166 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCCBP05166 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCCBP05166 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCCBP05166 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCCBP05166 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCCBP05166 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCCBP05166 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCCBP05166 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCCBP05166 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCCBP05166 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCCBP05166 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCCBP05166 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCCBP05166 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCCBP05166 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCCBP05166 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCCBP05166 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCCBP05166 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCCBP05166 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCCBP05166 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCCBP05166 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCCBP05166 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms