Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYBBP04839 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYBBP04839 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYBBP04839 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYBBP04839 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYBBP04839 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYBBP04839 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYBBP04839 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYBBP04839 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYBBP04839 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYBBP04839 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYBBP04839 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYBBP04839 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYBBP04839 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYBBP04839 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYBBP04839 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CYBBP04839 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYBBP04839 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYBBP04839 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYBBP04839 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYBBP04839 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYBBP04839 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYBBP04839 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYBBP04839 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYBBP04839 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CYBBP04839 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CYBBP04839 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYBBP04839 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYBBP04839 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYBBP04839 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYBBP04839 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYBBP04839 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYBBP04839 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYBBP04839 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYBBP04839 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYBBP04839 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYBBP04839 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYBBP04839 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYBBP04839 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYBBP04839 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYBBP04839 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYBBP04839 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYBBP04839 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CYBBP04839 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYBBP04839 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYBBP04839 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYBBP04839 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYBBP04839 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYBBP04839 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYBBP04839 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYBBP04839 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYBBP04839 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYBBP04839 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYBBP04839 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYBBP04839 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYBBP04839 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYBBP04839 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYBBP04839 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYBBP04839 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYBBP04839 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYBBP04839 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYBBP04839 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYBBP04839 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CYBBP04839 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYBBP04839 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYBBP04839 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYBBP04839 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYBBP04839 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYBBP04839 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYBBP04839 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYBBP04839 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYBBP04839 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYBBP04839 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYBBP04839 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYBBP04839 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYBBP04839 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYBBP04839 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYBBP04839 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYBBP04839 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYBBP04839 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYBBP04839 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYBBP04839 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYBBP04839 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYBBP04839 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYBBP04839 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYBBP04839 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYBBP04839 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYBBP04839 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYBBP04839 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYBBP04839 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYBBP04839 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYBBP04839 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYBBP04839 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYBBP04839 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYBBP04839 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYBBP04839 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYBBP04839 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYBBP04839 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYBBP04839 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYBBP04839 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms