Protein–RNA interactions for Protein: P04798

CYP1A1, Cytochrome P450 1A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP1A1P04798 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP1A1P04798 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CYP1A1P04798 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP1A1P04798 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYP1A1P04798 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYP1A1P04798 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP1A1P04798 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP1A1P04798 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP1A1P04798 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP1A1P04798 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP1A1P04798 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP1A1P04798 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP1A1P04798 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP1A1P04798 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms