Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPN1SWP03999 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1SWP03999 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN1SWP03999 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms