Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXCL10P02778 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CXCL10P02778 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL10P02778 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCL10P02778 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms