Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRBC1P01850 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRBC1P01850 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRBC1P01850 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms