Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINA3P01011 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINA3P01011 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA3P01011 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms