Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NSD2O96028 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NSD2O96028 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NSD2O96028 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NSD2O96028 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NSD2O96028 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NSD2O96028 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
NSD2O96028 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
NSD2O96028 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
NSD2O96028 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NSD2O96028 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
NSD2O96028 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NSD2O96028 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NSD2O96028 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NSD2O96028 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NSD2O96028 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
NSD2O96028 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NSD2O96028 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NSD2O96028 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NSD2O96028 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NSD2O96028 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NSD2O96028 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NSD2O96028 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NSD2O96028 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NSD2O96028 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NSD2O96028 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NSD2O96028 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NSD2O96028 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NSD2O96028 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NSD2O96028 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NSD2O96028 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NSD2O96028 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NSD2O96028 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NSD2O96028 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NSD2O96028 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NSD2O96028 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NSD2O96028 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NSD2O96028 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
NSD2O96028 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NSD2O96028 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NSD2O96028 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NSD2O96028 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NSD2O96028 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NSD2O96028 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NSD2O96028 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NSD2O96028 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NSD2O96028 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NSD2O96028 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NSD2O96028 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NSD2O96028 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NSD2O96028 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NSD2O96028 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NSD2O96028 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NSD2O96028 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NSD2O96028 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NSD2O96028 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NSD2O96028 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NSD2O96028 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NSD2O96028 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NSD2O96028 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NSD2O96028 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NSD2O96028 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NSD2O96028 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NSD2O96028 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NSD2O96028 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NSD2O96028 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NSD2O96028 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NSD2O96028 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NSD2O96028 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NSD2O96028 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NSD2O96028 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NSD2O96028 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NSD2O96028 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NSD2O96028 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NSD2O96028 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NSD2O96028 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NSD2O96028 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NSD2O96028 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NSD2O96028 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NSD2O96028 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NSD2O96028 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NSD2O96028 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NSD2O96028 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NSD2O96028 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NSD2O96028 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NSD2O96028 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NSD2O96028 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
NSD2O96028 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NSD2O96028 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NSD2O96028 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NSD2O96028 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NSD2O96028 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NSD2O96028 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NSD2O96028 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NSD2O96028 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NSD2O96028 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NSD2O96028 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NSD2O96028 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NSD2O96028 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NSD2O96028 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms