Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIC3O95833 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIC3O95833 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms