Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24AO95486 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24AO95486 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24AO95486 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24AO95486 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms