Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF4AO95239 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KIF4AO95239 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KIF4AO95239 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KIF4AO95239 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KIF4AO95239 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KIF4AO95239 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms