Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN7O94888 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBXN7O94888 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms