Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM63AO94886 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM63AO94886 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM63AO94886 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM63AO94886 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM63AO94886 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM63AO94886 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM63AO94886 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms