Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RECQL4O94761 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RECQL4O94761 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RECQL4O94761 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RECQL4O94761 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RECQL4O94761 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RECQL4O94761 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RECQL4O94761 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RECQL4O94761 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RECQL4O94761 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RECQL4O94761 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RECQL4O94761 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RECQL4O94761 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RECQL4O94761 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RECQL4O94761 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RECQL4O94761 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RECQL4O94761 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RECQL4O94761 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RECQL4O94761 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms