Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDKL5O76039 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDKL5O76039 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CDKL5O76039 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDKL5O76039 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms