Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA10O75578 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms