Protein–RNA interactions for Protein: O75469

NR1I2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I2O75469 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NR1I2O75469 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NR1I2O75469 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NR1I2O75469 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NR1I2O75469 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms