Protein–RNA interactions for Protein: O75112

LDB3, LIM domain-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB3O75112 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDB3O75112 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDB3O75112 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDB3O75112 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDB3O75112 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDB3O75112 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDB3O75112 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LDB3O75112 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDB3O75112 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDB3O75112 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LDB3O75112 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LDB3O75112 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LDB3O75112 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LDB3O75112 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LDB3O75112 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LDB3O75112 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LDB3O75112 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDB3O75112 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDB3O75112 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDB3O75112 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDB3O75112 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDB3O75112 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB3O75112 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB3O75112 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB3O75112 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB3O75112 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDB3O75112 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDB3O75112 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDB3O75112 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDB3O75112 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDB3O75112 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDB3O75112 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB3O75112 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB3O75112 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB3O75112 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB3O75112 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB3O75112 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB3O75112 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDB3O75112 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDB3O75112 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDB3O75112 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDB3O75112 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LDB3O75112 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LDB3O75112 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDB3O75112 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDB3O75112 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LDB3O75112 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDB3O75112 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDB3O75112 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDB3O75112 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDB3O75112 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDB3O75112 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDB3O75112 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDB3O75112 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LDB3O75112 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDB3O75112 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB3O75112 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB3O75112 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB3O75112 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB3O75112 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB3O75112 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB3O75112 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB3O75112 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB3O75112 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB3O75112 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB3O75112 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB3O75112 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB3O75112 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB3O75112 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB3O75112 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB3O75112 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB3O75112 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB3O75112 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB3O75112 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB3O75112 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDB3O75112 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDB3O75112 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDB3O75112 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDB3O75112 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDB3O75112 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDB3O75112 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB3O75112 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB3O75112 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB3O75112 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB3O75112 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB3O75112 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB3O75112 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB3O75112 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB3O75112 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB3O75112 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LDB3O75112 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LDB3O75112 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LDB3O75112 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDB3O75112 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDB3O75112 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDB3O75112 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDB3O75112 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDB3O75112 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB3O75112 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB3O75112 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms