Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP9AO75110 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP9AO75110 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP9AO75110 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms