Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYTIPO60759 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYTIPO60759 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTIPO60759 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYTIPO60759 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYTIPO60759 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTIPO60759 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTIPO60759 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTIPO60759 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTIPO60759 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTIPO60759 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTIPO60759 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTIPO60759 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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