Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL41O60662 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL41O60662 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL41O60662 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms