Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFRA3O60609 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GFRA3O60609 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFRA3O60609 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA3O60609 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms