Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLOD3O60568 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLOD3O60568 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLOD3O60568 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms