Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME2P1O60361 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME2P1O60361 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME2P1O60361 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms