Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUPR1O60356 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPR1O60356 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUPR1O60356 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms