Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LANCL1O43813 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LANCL1O43813 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LANCL1O43813 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms