Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STX6O43752 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STX6O43752 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STX6O43752 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STX6O43752 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STX6O43752 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STX6O43752 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STX6O43752 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STX6O43752 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STX6O43752 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
STX6O43752 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STX6O43752 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STX6O43752 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STX6O43752 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STX6O43752 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STX6O43752 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STX6O43752 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STX6O43752 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STX6O43752 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STX6O43752 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
STX6O43752 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STX6O43752 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
STX6O43752 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STX6O43752 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STX6O43752 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STX6O43752 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STX6O43752 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STX6O43752 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
STX6O43752 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
STX6O43752 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STX6O43752 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STX6O43752 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STX6O43752 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STX6O43752 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STX6O43752 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STX6O43752 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STX6O43752 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STX6O43752 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STX6O43752 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STX6O43752 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STX6O43752 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STX6O43752 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STX6O43752 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STX6O43752 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STX6O43752 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STX6O43752 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STX6O43752 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STX6O43752 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STX6O43752 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STX6O43752 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STX6O43752 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STX6O43752 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STX6O43752 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STX6O43752 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STX6O43752 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STX6O43752 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
STX6O43752 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STX6O43752 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
STX6O43752 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STX6O43752 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STX6O43752 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX6O43752 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX6O43752 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX6O43752 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX6O43752 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STX6O43752 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STX6O43752 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STX6O43752 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STX6O43752 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STX6O43752 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
STX6O43752 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
STX6O43752 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STX6O43752 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
STX6O43752 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STX6O43752 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STX6O43752 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX6O43752 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX6O43752 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX6O43752 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX6O43752 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX6O43752 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX6O43752 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX6O43752 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STX6O43752 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STX6O43752 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STX6O43752 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms