Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GATCO43716 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GATCO43716 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GATCO43716 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GATCO43716 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GATCO43716 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GATCO43716 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GATCO43716 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GATCO43716 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GATCO43716 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GATCO43716 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GATCO43716 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GATCO43716 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GATCO43716 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GATCO43716 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GATCO43716 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATCO43716 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATCO43716 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATCO43716 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATCO43716 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATCO43716 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATCO43716 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATCO43716 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATCO43716 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATCO43716 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATCO43716 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATCO43716 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATCO43716 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATCO43716 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATCO43716 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GATCO43716 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATCO43716 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATCO43716 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GATCO43716 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATCO43716 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATCO43716 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATCO43716 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATCO43716 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATCO43716 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GATCO43716 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATCO43716 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATCO43716 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATCO43716 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATCO43716 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATCO43716 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATCO43716 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GATCO43716 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATCO43716 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATCO43716 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATCO43716 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATCO43716 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATCO43716 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATCO43716 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATCO43716 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATCO43716 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATCO43716 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GATCO43716 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GATCO43716 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GATCO43716 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GATCO43716 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GATCO43716 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GATCO43716 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GATCO43716 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GATCO43716 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GATCO43716 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
GATCO43716 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GATCO43716 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GATCO43716 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GATCO43716 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GATCO43716 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GATCO43716 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GATCO43716 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GATCO43716 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GATCO43716 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GATCO43716 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GATCO43716 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GATCO43716 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GATCO43716 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GATCO43716 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GATCO43716 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GATCO43716 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GATCO43716 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GATCO43716 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GATCO43716 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GATCO43716 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GATCO43716 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GATCO43716 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GATCO43716 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GATCO43716 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GATCO43716 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GATCO43716 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GATCO43716 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GATCO43716 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GATCO43716 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GATCO43716 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GATCO43716 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GATCO43716 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GATCO43716 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GATCO43716 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GATCO43716 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms