Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMM44O43615 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMM44O43615 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms