Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF208O43345 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF208O43345 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms