Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPAA1O43292 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPAA1O43292 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPAA1O43292 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms