Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFS4O43181 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDUFS4O43181 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFS4O43181 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFS4O43181 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFS4O43181 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFS4O43181 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFS4O43181 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFS4O43181 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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