Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GSC2O15499 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GSC2O15499 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GSC2O15499 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GSC2O15499 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GSC2O15499 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSC2O15499 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSC2O15499 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSC2O15499 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSC2O15499 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSC2O15499 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSC2O15499 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSC2O15499 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSC2O15499 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSC2O15499 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSC2O15499 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSC2O15499 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GSC2O15499 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSC2O15499 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSC2O15499 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSC2O15499 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSC2O15499 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSC2O15499 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSC2O15499 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSC2O15499 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSC2O15499 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSC2O15499 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSC2O15499 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSC2O15499 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSC2O15499 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSC2O15499 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSC2O15499 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSC2O15499 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSC2O15499 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSC2O15499 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSC2O15499 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSC2O15499 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSC2O15499 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSC2O15499 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSC2O15499 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSC2O15499 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSC2O15499 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSC2O15499 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSC2O15499 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GSC2O15499 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSC2O15499 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSC2O15499 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSC2O15499 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSC2O15499 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSC2O15499 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSC2O15499 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSC2O15499 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSC2O15499 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSC2O15499 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSC2O15499 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSC2O15499 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSC2O15499 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSC2O15499 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSC2O15499 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSC2O15499 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSC2O15499 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSC2O15499 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSC2O15499 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSC2O15499 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSC2O15499 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSC2O15499 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSC2O15499 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSC2O15499 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSC2O15499 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSC2O15499 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSC2O15499 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSC2O15499 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSC2O15499 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSC2O15499 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSC2O15499 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GSC2O15499 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSC2O15499 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSC2O15499 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSC2O15499 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSC2O15499 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GSC2O15499 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSC2O15499 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSC2O15499 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSC2O15499 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSC2O15499 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSC2O15499 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSC2O15499 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSC2O15499 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSC2O15499 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSC2O15499 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSC2O15499 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSC2O15499 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSC2O15499 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSC2O15499 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSC2O15499 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSC2O15499 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSC2O15499 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSC2O15499 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSC2O15499 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSC2O15499 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms