Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIPC1O14908 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIPC1O14908 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms