Protein–RNA interactions for Protein: O14770

MEIS2, Homeobox protein Meis2, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS2O14770 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS2O14770 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEIS2O14770 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MEIS2O14770 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS2O14770 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS2O14770 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MEIS2O14770 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS2O14770 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS2O14770 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS2O14770 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS2O14770 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS2O14770 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms