Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOCS6O14544 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOCS6O14544 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms