Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOCS3O14543 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS3O14543 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS3O14543 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 653.6 ms