Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
CUX2O14529 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CUX2O14529 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
CUX2O14529 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CUX2O14529 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CUX2O14529 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CUX2O14529 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CUX2O14529 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
CUX2O14529 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CUX2O14529 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
CUX2O14529 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CUX2O14529 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
CUX2O14529 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.51
CUX2O14529 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CUX2O14529 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CUX2O14529 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CUX2O14529 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CUX2O14529 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
CUX2O14529 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CUX2O14529 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CUX2O14529 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CUX2O14529 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CUX2O14529 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CUX2O14529 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CUX2O14529 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CUX2O14529 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CUX2O14529 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
CUX2O14529 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CUX2O14529 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CUX2O14529 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CUX2O14529 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CUX2O14529 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC43.13■■■■■ 4.5
CUX2O14529 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
CUX2O14529 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
CUX2O14529 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CUX2O14529 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CUX2O14529 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CUX2O14529 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CUX2O14529 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CUX2O14529 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CUX2O14529 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CUX2O14529 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
CUX2O14529 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
CUX2O14529 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CUX2O14529 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CUX2O14529 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CUX2O14529 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
CUX2O14529 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CUX2O14529 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
CUX2O14529 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
CUX2O14529 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
CUX2O14529 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CUX2O14529 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CUX2O14529 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CUX2O14529 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CUX2O14529 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC43.05■■■■■ 4.48
CUX2O14529 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
CUX2O14529 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CUX2O14529 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CUX2O14529 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CUX2O14529 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CUX2O14529 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
CUX2O14529 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
CUX2O14529 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CUX2O14529 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
CUX2O14529 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CUX2O14529 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CUX2O14529 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CUX2O14529 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CUX2O14529 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CUX2O14529 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CUX2O14529 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CUX2O14529 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CUX2O14529 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CUX2O14529 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CUX2O14529 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CUX2O14529 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
CUX2O14529 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CUX2O14529 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
CUX2O14529 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
CUX2O14529 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CUX2O14529 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CUX2O14529 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CUX2O14529 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CUX2O14529 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
CUX2O14529 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CUX2O14529 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CUX2O14529 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CUX2O14529 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CUX2O14529 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CUX2O14529 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CUX2O14529 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
CUX2O14529 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CUX2O14529 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CUX2O14529 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
CUX2O14529 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CUX2O14529 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CUX2O14529 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CUX2O14529 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.46
CUX2O14529 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms