Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

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Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
CUX2O14529 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CUX2O14529 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
CUX2O14529 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CUX2O14529 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CUX2O14529 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CUX2O14529 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CUX2O14529 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
CUX2O14529 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CUX2O14529 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
CUX2O14529 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CUX2O14529 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
CUX2O14529 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.51
CUX2O14529 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CUX2O14529 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CUX2O14529 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CUX2O14529 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CUX2O14529 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
CUX2O14529 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CUX2O14529 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CUX2O14529 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CUX2O14529 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CUX2O14529 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CUX2O14529 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CUX2O14529 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CUX2O14529 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CUX2O14529 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
CUX2O14529 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CUX2O14529 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CUX2O14529 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CUX2O14529 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CUX2O14529 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC43.13■■■■■ 4.5
CUX2O14529 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
CUX2O14529 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
CUX2O14529 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CUX2O14529 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CUX2O14529 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CUX2O14529 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CUX2O14529 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CUX2O14529 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CUX2O14529 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CUX2O14529 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
CUX2O14529 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
CUX2O14529 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CUX2O14529 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CUX2O14529 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CUX2O14529 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
CUX2O14529 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CUX2O14529 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
CUX2O14529 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
CUX2O14529 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
CUX2O14529 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CUX2O14529 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CUX2O14529 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CUX2O14529 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CUX2O14529 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC43.05■■■■■ 4.48
CUX2O14529 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
CUX2O14529 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CUX2O14529 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CUX2O14529 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CUX2O14529 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CUX2O14529 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
CUX2O14529 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
CUX2O14529 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CUX2O14529 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
CUX2O14529 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CUX2O14529 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CUX2O14529 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CUX2O14529 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CUX2O14529 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CUX2O14529 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CUX2O14529 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CUX2O14529 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CUX2O14529 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CUX2O14529 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CUX2O14529 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CUX2O14529 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
CUX2O14529 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CUX2O14529 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
CUX2O14529 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
CUX2O14529 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CUX2O14529 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CUX2O14529 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CUX2O14529 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CUX2O14529 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
CUX2O14529 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CUX2O14529 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CUX2O14529 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CUX2O14529 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CUX2O14529 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CUX2O14529 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CUX2O14529 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
CUX2O14529 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CUX2O14529 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CUX2O14529 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
CUX2O14529 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CUX2O14529 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CUX2O14529 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CUX2O14529 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.46
CUX2O14529 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.46
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