Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS1O00470 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MEIS1O00470 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms