Protein–RNA interactions for Protein: O00422

SAP18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP18O00422 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAP18O00422 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAP18O00422 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAP18O00422 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAP18O00422 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAP18O00422 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAP18O00422 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAP18O00422 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP18O00422 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAP18O00422 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAP18O00422 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAP18O00422 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAP18O00422 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAP18O00422 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAP18O00422 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAP18O00422 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAP18O00422 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAP18O00422 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAP18O00422 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAP18O00422 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAP18O00422 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAP18O00422 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAP18O00422 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAP18O00422 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAP18O00422 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAP18O00422 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAP18O00422 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAP18O00422 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAP18O00422 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAP18O00422 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAP18O00422 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAP18O00422 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAP18O00422 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAP18O00422 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SAP18O00422 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAP18O00422 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SAP18O00422 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAP18O00422 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAP18O00422 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAP18O00422 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SAP18O00422 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAP18O00422 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAP18O00422 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAP18O00422 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAP18O00422 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAP18O00422 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAP18O00422 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP18O00422 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP18O00422 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP18O00422 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP18O00422 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAP18O00422 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SAP18O00422 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAP18O00422 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAP18O00422 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAP18O00422 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAP18O00422 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAP18O00422 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAP18O00422 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAP18O00422 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAP18O00422 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAP18O00422 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAP18O00422 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAP18O00422 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAP18O00422 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAP18O00422 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAP18O00422 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP18O00422 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP18O00422 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP18O00422 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP18O00422 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP18O00422 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP18O00422 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP18O00422 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP18O00422 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP18O00422 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP18O00422 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP18O00422 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP18O00422 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP18O00422 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP18O00422 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAP18O00422 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAP18O00422 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAP18O00422 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAP18O00422 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAP18O00422 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms