Protein–RNA interactions for Protein: O00358

FOXE1, Forkhead box protein E1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE1O00358 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXE1O00358 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXE1O00358 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXE1O00358 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms