Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEN1O00255 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEN1O00255 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEN1O00255 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEN1O00255 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEN1O00255 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEN1O00255 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEN1O00255 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEN1O00255 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEN1O00255 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEN1O00255 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEN1O00255 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEN1O00255 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEN1O00255 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEN1O00255 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEN1O00255 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEN1O00255 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEN1O00255 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEN1O00255 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEN1O00255 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEN1O00255 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MEN1O00255 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MEN1O00255 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEN1O00255 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MEN1O00255 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEN1O00255 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEN1O00255 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEN1O00255 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEN1O00255 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MEN1O00255 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEN1O00255 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEN1O00255 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEN1O00255 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEN1O00255 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEN1O00255 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEN1O00255 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEN1O00255 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEN1O00255 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEN1O00255 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEN1O00255 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEN1O00255 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEN1O00255 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEN1O00255 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEN1O00255 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEN1O00255 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEN1O00255 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEN1O00255 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEN1O00255 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEN1O00255 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEN1O00255 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEN1O00255 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEN1O00255 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEN1O00255 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEN1O00255 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEN1O00255 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEN1O00255 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEN1O00255 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEN1O00255 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEN1O00255 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEN1O00255 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEN1O00255 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEN1O00255 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEN1O00255 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEN1O00255 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEN1O00255 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEN1O00255 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MEN1O00255 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEN1O00255 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEN1O00255 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEN1O00255 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEN1O00255 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEN1O00255 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEN1O00255 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEN1O00255 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEN1O00255 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEN1O00255 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEN1O00255 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEN1O00255 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEN1O00255 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEN1O00255 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEN1O00255 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEN1O00255 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEN1O00255 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEN1O00255 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEN1O00255 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MEN1O00255 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEN1O00255 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEN1O00255 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEN1O00255 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEN1O00255 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEN1O00255 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEN1O00255 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEN1O00255 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEN1O00255 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEN1O00255 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEN1O00255 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEN1O00255 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEN1O00255 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MEN1O00255 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEN1O00255 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms