Protein–RNA interactions for Protein: O00244

ATOX1, Copper transport protein ATOX1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOX1O00244 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATOX1O00244 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATOX1O00244 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATOX1O00244 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms