Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARVCFO00192 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARVCFO00192 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ARVCFO00192 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARVCFO00192 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms