Protein–RNA interactions for Protein: O00186

STXBP3, Syntaxin-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STXBP3O00186 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STXBP3O00186 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
STXBP3O00186 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STXBP3O00186 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STXBP3O00186 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STXBP3O00186 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms