Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms