Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
H7C1D1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
H7C1D1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
H7C1D1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
H7C1D1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1D1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1D1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1D1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1D1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1D1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1D1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
H7C1D1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
H7C1D1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
H7C1D1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
H7C1D1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
H7C1D1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
H7C1D1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
H7C1D1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
H7C1D1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
H7C1D1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
H7C1D1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
H7C1D1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
H7C1D1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
H7C1D1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
H7C1D1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
H7C1D1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
H7C1D1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
H7C1D1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
H7C1D1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
H7C1D1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
H7C1D1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
H7C1D1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
H7C1D1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
H7C1D1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
H7C1D1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
H7C1D1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
H7C1D1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
H7C1D1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
H7C1D1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
H7C1D1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
H7C1D1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
H7C1D1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
H7C1D1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
H7C1D1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
H7C1D1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
H7C1D1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
H7C1D1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
H7C1D1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
H7C1D1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
H7C1D1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
H7C1D1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
H7C1D1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
H7C1D1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
H7C1D1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
H7C1D1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
H7C1D1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
H7C1D1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
H7C1D1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
H7C1D1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
H7C1D1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
H7C1D1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
H7C1D1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
H7C1D1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
H7C1D1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
H7C1D1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
H7C1D1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
H7C1D1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
H7C1D1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
H7C1D1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
H7C1D1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
H7C1D1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
H7C1D1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
H7C1D1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
H7C1D1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
H7C1D1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
H7C1D1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
H7C1D1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
H7C1D1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
H7C1D1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
H7C1D1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
H7C1D1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
H7C1D1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
H7C1D1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
H7C1D1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
H7C1D1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
H7C1D1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
H7C1D1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
H7C1D1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
H7C1D1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
H7C1D1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
H7C1D1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
H7C1D1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
H7C1D1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1D1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1D1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1D1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1D1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1D1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1D1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1D1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms