Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3BRM9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3BRM9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3BRM9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3BRM9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3BRM9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3BRM9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H3BRM9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H3BRM9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H3BRM9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H3BRM9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H3BRM9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H3BRM9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H3BRM9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3BRM9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3BRM9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3BRM9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3BRM9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3BRM9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3BRM9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BRM9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BRM9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BRM9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BRM9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BRM9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BRM9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BRM9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BRM9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BRM9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BRM9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BRM9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BRM9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BRM9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3BRM9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3BRM9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3BRM9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3BRM9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3BRM9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BRM9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BRM9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BRM9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BRM9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BRM9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BRM9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BRM9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BRM9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BRM9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BRM9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BRM9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BRM9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BRM9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BRM9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BRM9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BRM9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BRM9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BRM9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BRM9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BRM9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BRM9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BRM9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H3BRM9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H3BRM9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H3BRM9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H3BRM9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H3BRM9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H3BRM9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H3BRM9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H3BRM9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H3BRM9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H3BRM9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H3BRM9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H3BRM9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H3BRM9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BRM9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BRM9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BRM9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BRM9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BRM9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BRM9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BRM9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BRM9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BRM9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BRM9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H3BRM9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H3BRM9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H3BRM9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H3BRM9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H3BRM9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H3BRM9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H3BRM9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H3BRM9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H3BRM9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H3BRM9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H3BRM9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
H3BRM9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H3BRM9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H3BRM9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H3BRM9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H3BRM9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H3BRM9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 374.7 ms